Las dos cadenas de una molécula de ADN están unidas por enlaces de hidrógeno entre los nucleótidos de cada cadena. Las cuatro nucleitudes se emparejan de tal manera que AT forma dos enlaces de hidrógeno y GC forma tres enlaces H. Un ADN con más contenido de GC contribuye así a más no. de enlaces H en el ADN. Por ejemplo, en una molécula de ADN de 10 pares de bases, digamos que tenemos 6 GC y 4 AT. El no. de enlaces H = (6 * 3) + (4 * 2) = 26. Ahora cuando tenemos 4 GC y 6 AT, enlaces H = (4 * 3) + (6 * 2) = 24. Del ejemplo , la energía total requerida para romper 26 enlaces de hidrógeno es mayor que la requerida para 24 enlaces.
Entonces, la estabilidad del ADN en un ADN con más contenido de GC es mayor ya que tenemos más no. de enlaces H Esto se aplica en el diseño del cebador y para establecer la temperatura de reunión para el par cebador-producto en una reacción de PCR.
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