Mi respuesta aquí cubre algo de esto:
Si se cree que una proporción significativa del genoma basura humano es de origen retroviral inactivo, entonces, ¿cómo invadió el virus las células reproductivas y pasó por el control de reproducción?
La respuesta corta es a través de alineamientos con motivos y secuencias virales conocidos. Las alineaciones se encuentran entre los métodos más utilizados en bioinformática: básicamente, suponemos que dos secuencias similares probablemente comparten orígenes y funciones.
Los virus mutan rápidamente, pero aún se conservan muchos motivos y secuencias centrales. Además, debido a que la transposición está activa, no hay tiempo suficiente para que muten. Recuerde, una vez que ingresan al genoma humano, su tasa de mutación coincide con la de la replicación del ADN (~ 10 ^ -9), no las tasas de mutación viral (10 ^ -3 a 10 ^ -5 para los virus de ARN, 10 ^ -6 a 10 ^ -8 para virus de ADN).
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Curiosamente, es algo al revés. Los retrovirus se originaron a partir de elementos transponibles endógenos, no al revés.
Y si quieres ver qué tan rápido se propagan estas cosas, mira esto:
La reciente invasión de poblaciones naturales de Drosophila simulans por el elemento P
Drosophila simulans fue invadida recientemente por transposones de elementos P (los últimos 10 años). Este no es un retrotransposón (es un elemento de ADN de Clase II) pero es un buen ejemplo porque podemos observar que esto sucede en tiempo real.
