Es muy poco probable. Es difícil imaginar un patógeno que afecte a una gama tan amplia de organismos, tanto vertebrados como invertebrados, en la tierra y en el mar, incluso plantas y animales. (Las plantas parecen sobrevivir mejor a las extinciones en masa que los animales, pero aún se ven considerablemente afectadas).
Los microorganismos son bastante específicos sobre los tipos de organismos en los que pueden sobrevivir. Incluso los que atraviesan múltiples organismos en su ciclo de vida siguen siendo bastante específicos sobre qué huéspedes necesitan en cada etapa. Es por eso que sus mascotas no contraen resfriados, o viceversa: a pesar de ser muy transmisible, el virus se basa en aspectos específicos del metabolismo humano (o, como máximo, de primates). Y en el esquema de las cosas, los humanos y los perros están muy relacionados, en comparación con los peces, los insectos y las medusas.
Entonces, dada la forma en que las extinciones masivas parecen bastante indiscriminadas, es muy poco probable que sea un patógeno. Es mucho más probable que sea climático, algo que puede afectar a todas las especies a la vez.
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