Lo más importante para recordar acerca de la prolina es el anillo que lleva el grupo amina y la restricción que esto pone en el ángulo entre la amina y el carboxilo en un polipéptido.
Pegar una prolina en cualquier lugar provoca un pliegue en la cadena que potencialmente interrumpe la forma en que la proteína se pliega y, por lo tanto, su función. Esta puede ser la causa del problema con la mutación que describe, puede que no. El plegamiento de proteínas aún no se entiende bien.
Con la arginina hay un gran bulto de carga positiva al final. Si está cerca del canal principal para el transporte de iones de cloro, esto puede ser un factor.
La histidina también tiene una carga positiva, pero no tan fuerte, y el tamaño y la forma del anillo aromático en comparación con el guanidinio en la arginina pueden estar afectando nuevamente el plegamiento de proteínas. En el mejor de los casos, tendrá un canal ineficiente con esta sustitución.
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No sé si se han hecho modelos del CFTR con y sin la mutación, verifique la biofísica encendida, sería interesante verlos uno al lado del otro.