¿Cuáles son los enfoques experimentales basados ​​en genética disponibles para mapear la ubicación de los genes de baja penetrancia?

La penetración es un término para la probabilidad de que una persona que porta un genotipo particular tenga un fenotipo específico (rasgo de interés). No es el ‘gen’ que tiene penetrancia, sino sus estados variantes (llamados ‘alelos’) en diferentes personas. Si la penetrancia de un genotipo particular es baja, eso significa que llevar ese genotipo solo afecta levemente la probabilidad de manifestar el rasgo. La baja penetración generalmente significa baja capacidad de mapeo ya que el mapeo generalmente se trata de asociaciones estadísticas entre genotipos y rasgos en las muestras.

Los enfoques experimentales tienden a aislar una variante genética candidata particular en un animal modelo, como la ingeniería en un ratón de laboratorio. Luego, y / o con otros métodos experimentales para ver qué hace funcionalmente la variante (probar si se expresa en las células, o qué hace la proteína en sus diversos estados), uno puede tener una idea de lo que está haciendo el gen y por qué La variante tiene el efecto detectado.

Pero su pregunta es sobre ‘mapear’ la ubicación, e incluso los organismos modelo no funcionarán bien para eso. En lugar de experimentos, a menudo se buscan familias en las que el rasgo es común porque los efectos del gen pueden ser fuertes (tener alta penetrancia). Una vez que el gen se encuentra en tales familias, se pueden estudiar los efectos de sus variantes en la población general, que en promedio pueden ser débiles. Pero si los efectos promedio son pequeños, incluso los casos ‘familiares’ probablemente se deban a otros aspectos de sus genomas que no están enmascarando el gen en cuestión.

Finalmente, por supuesto, los genes interactúan con los entornos para que uno pueda detectar factores ambientales o de estilo de vida que, en algunas circunstancias, evocan los efectos del gen. Para todos los que no están expuestos a esos factores, la misma variante genética quizás no tenga ningún efecto, al menos, eso es lo que generalmente significa ‘baja penetrancia’.