¿Tiene un átomo una fragancia u olor?

El olor ocurre cuando las moléculas interactúan con las proteínas receptoras en la nariz. La forma y el tamaño de la molécula es la clave para los receptores olfativos que activa y el olor que se detecta.

Que yo sepa, no hay gases elementales monoatómicos que tengan olor a temperatura ambiente. Todos los gases nobles son inodoros. El olor parece aumentar con a) mayor tamaño de los átomos (H2O es inodoro mientras que H2S no lo es), b) o mayor complejidad molecular (CH4 es inodoro mientras que el hexano no lo es).

Diré que ciertos metales tienen olores, y los metales son monoatómicos. No estoy seguro de si esto se debe a que los átomos metálicos monoatómicos interactúan con los receptores o las nanopartículas del metal que interactúan con los receptores, o posiblemente los residuos que quedan en los metales durante el procesamiento. (Nota agregada más tarde: busqué esto y el olor a metal se atribuye a las interacciones entre el metal y los compuestos en su piel, no a los átomos de metal en sí)

Es interesante notar que hay una ventana estrecha de complejidad antes de que una molécula se vuelva tan grande que no sea volátil y no tenga suficiente presión de vapor para que sea detectada. Además, algunas moléculas tienen isómeros de imagen especular (enantiómeros) que exhiben diferentes olores (ver carvona)

No, la fragancia es en realidad el resultado de reacciones químicas.

La fragancia se produce debido a los diversos cambios químicos en los átomos y las moléculas cuando reaccionan entre sí.