No, o muy poco probable.
En primer lugar, ese tipo de herencia sería fácil de reconocer para los biólogos. El autismo parece tener algunos elementos de influencia genética, pero no en un patrón simple y claro como el de la herencia mitocondrial.
En segundo lugar, los genes en las mitocondrias son muy pocos (37, de aproximadamente 20,000 en un ser humano), y sabemos qué genes son esos. Son genes utilizados en la respiración celular, cómo las células obtienen energía de los azúcares y grasas, y genes utilizados como parte de los procesos de producción de proteínas de la célula (ARNt y ARNr). No se esperaría que ninguno de estos afecte el desarrollo neuronal, o al menos no el desarrollo neuronal sin afectar muchas otras cosas también.
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Los trastornos conocidos de los genes mitocondriales a menudo son trastornos horribles con debilidad muscular como síntoma porque las células musculares tienen una gran demanda de energía cuando realizan su trabajo. Las neuronas (células cerebrales) también usan una gran cantidad de energía, y las mutaciones mitocondriales a veces afectan el desarrollo del cerebro. Pero debido a que prácticamente todas las células necesitan energía producida por las mitocondrias, generalmente hay síntomas en múltiples órganos y sistemas. Creo que múltiples sistemas afectados son incluso un indicador para sugerir a los médicos cuándo los trastornos mitocondriales pueden estar involucrados en el diagnóstico de un paciente, pero no sé mucho sobre el lado médico de estos trastornos mitocondriales.
Por último, el autismo a menudo no se nota en el desarrollo temprano, y solo cuando un niño es mayor. Eso no es consistente con un trastorno mitocondrial, que generalmente ya mostraría síntomas en bebés o niños pequeños.