Para ser honesto, no sé mucho sobre biología de sistemas, pero hace unas semanas leí un poco sobre una startup y luego encontré este documento que podría ser genial compartir aquí:
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Kell, DB (2006), Metabolómica, modelado y aprendizaje automático en biología de sistemas: hacia una comprensión de los lenguajes de las células. FEBS Journal, 273: 873–894. doi: 10.1111 / j.1742-4658.2006.05136.x
Fuente: sitio de WhitePaper
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tl; dr
Por lo tanto, pasa por:
Página 3
Luego: 
Para el largo proceso y las razones mencionadas en el documento, realizar Text Mining y Machine Learning puede traer nuevas opciones al campo, o como una acción realizada en lugar de la forma en que se realiza para obtener los mismos resultados:
Que hacer
Creación y análisis de modelos de biología de sistemas:
motivos de red, análisis de sensibilidad, funcional
enlace y procesamiento de señal
