¿Podría el ADN basura generar nuevos genes?

Si.

Los pseudogenes pueden reactivarse o formar nuevos genes (o subfunciones).
Reactivación por combinación de exón de un segmento de pseudogen similar a HLA-DR3 conservado en una especie de primates del Nuevo Mundo
Las diferencias en la selección conducen los genes del receptor olfativo en diferentes direcciones en perros y lobos

Los siRNA y miRNA funcionales surgieron casi con seguridad de la “basura”.

Los transposones pueden ser “domesticados” en elementos reguladores.
Un elemento transponible es domesticado para el servicio en el sistema inmune de la planta.

Una cosa a tener en cuenta sobre todos estos ejemplos: todos están relacionados con la detección de señales / respuestas inmunes, que son vías que requieren mucha diversidad.

Por lo menos, estos elementos, por su naturaleza a menudo disruptiva, pueden interrumpir genes o jugar con otras cosas como el emparejamiento de cromosomas. La mutación genera variación, que generalmente es perjudicial, pero como la suerte lo tendría, a veces es útil.

Pero dado que vinculaste una de las conversaciones de Ian York, debo enfatizar que todavía es basura. Estas son excepciones. Hay muchas excepciones, y algunas son importantes, pero la mayoría del ADN eucariota, en la gran mayoría de las especies, es basura.

La palabra “basura” ya debería ir a la basura hace mucho tiempo.

El caso más simple es cuando la misma secuencia contiene más de 1 loci transcribibles (partes de la secuencia), cuando las secuencias de diferentes fragmentos transcriptos se superponen parcialmente. Diga “g1” y “g2”.

Por lo tanto, desde el punto de vista de “g1”, parte de “g2” es … (ugh) “basura”, ya que nunca se transcribe cuando se transcribe “g1”. Y viceversa.

Las variaciones más complejas pueden verse más fácilmente en el ADN circular (como el procariota) cuando un bucle se retuerce, se cruza, se recombina y de esta manera aparecen diferentes loci para la transcripción.

En general, el ADN “no codificante” es el caso general que permite todas las dinámicas moleculares y el “comportamiento del ADN”, mientras que el ADN “codificante” es un caso específico de eso.

Pasa todo el tiempo. De hecho, así es como surgen los nuevos genes.

En primer lugar, los ADN basura no son basura. Algunos de ellos juegan un papel crucial en las regulaciones genéticas.

Deja esto a un lado. Esos ADN no codificantes también pueden convertirse en ADN codificante dadas las mutaciones apropiadas.

No todas las secuencias de proteínas son plegables. Es probable que un péptido aleatorio se marque con ubiquitina y se envíe al proteasoma para su reciclaje.