Si.
Los pseudogenes pueden reactivarse o formar nuevos genes (o subfunciones).
Reactivación por combinación de exón de un segmento de pseudogen similar a HLA-DR3 conservado en una especie de primates del Nuevo Mundo
Las diferencias en la selección conducen los genes del receptor olfativo en diferentes direcciones en perros y lobos
Los siRNA y miRNA funcionales surgieron casi con seguridad de la “basura”.
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Los transposones pueden ser “domesticados” en elementos reguladores.
Un elemento transponible es domesticado para el servicio en el sistema inmune de la planta.
Una cosa a tener en cuenta sobre todos estos ejemplos: todos están relacionados con la detección de señales / respuestas inmunes, que son vías que requieren mucha diversidad.
Por lo menos, estos elementos, por su naturaleza a menudo disruptiva, pueden interrumpir genes o jugar con otras cosas como el emparejamiento de cromosomas. La mutación genera variación, que generalmente es perjudicial, pero como la suerte lo tendría, a veces es útil.
Pero dado que vinculaste una de las conversaciones de Ian York, debo enfatizar que todavía es basura. Estas son excepciones. Hay muchas excepciones, y algunas son importantes, pero la mayoría del ADN eucariota, en la gran mayoría de las especies, es basura.