En general, la modificación de m6A se puede detectar en los ARNm de más de 7,000 genes en células de mamíferos, y tiende a ocurrir en el motivo RRACH de consenso (R = G o A; H = A, C o U) (Bodi et al. , 2010; Dominissini et al., 2012; Harper et al., 1990; Meyer et al., 2012; Wei y Moss, 1977). En promedio, la frecuencia de modificación de m6A es de aproximadamente un pico por cada 2,000 nucleótidos (nts), pero también hay algunas regiones con picos de m6A agrupados (Dominissini et al., 2012; Kane y Beemon, 1985; Meyer et al., 2012) . Se ha encontrado un fuerte enriquecimiento de la modificación de m6A cerca de los codones de parada de los ARNm (Dominissini et al., 2012; Meyer et al., 2012).
Aunque la existencia de m6A no cambia la capacidad de codificación o el emparejamiento de bases de adenina con uracilo o timina, puede bloquear el emparejamiento de bases A: G no estándar e influir en las estructuras de ARN (Dai et al., 2007). La presencia de m6A también puede afectar el nivel de expresión, la eficiencia de la traducción, la retención nuclear, el empalme y la estabilidad de los ARNm (Camper et al., 1984; Finkel y Groner, 1983; Fustin et al., 2013; He, 2010; Hess et al., 2013; Liu et al., 2014; Ping et al., 2014; Schwartz et al., 2013; Tuck et al., 1999; Wang et al., 2014a; Wang et al., 2014b; Zhao et al. ., 2014; Zheng et al., 2013).
¿Qué pasa con la modificación del ADN m6A …?
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La metilación del ADN es un mecanismo epigenético involucrado en muchas funciones biológicas en procariotas y eucariotas. A diferencia del ADN de mamíferos, que se cree que contiene solo 5-metilcitosina (m5C), el ADN bacteriano contiene dos bases metiladas adicionales, a saber, N6-metiladenina (m6A) y una base menor N4-metilcitosina (m4C) descubierta más recientemente. Estas bases modificadas están involucradas en la protección del ADN bacteriano de la acción de endonucleasas específicas a través del sistema de restricción-modificación específico del huésped que se considera como un mecanismo de defensa contra la infección por bacteriófagos. Sin embargo, si la función principal de m5C y m4C en las bacterias es la protección contra las enzimas de restricción, las funciones de m6A son múltiples e incluyen, por ejemplo, la regulación de la virulencia y el control de muchas funciones del ADN bacteriano, como la replicación, reparación, expresión y transposición de ADN.
Sin embargo, incluso si la metilación de adenina se considera generalmente como una característica de ADN bacteriano, la presencia de m6A no se limita al ADN procariota ya que esta base metilada se ha encontrado en ADN protista y vegetal. Además, la evidencia indirecta sugiere la presencia de m6A en el ADN de mamíferos, lo que aumenta la posibilidad de que esta base haya permanecido sin ser detectada debido a la baja sensibilidad de los métodos analíticos utilizados. Esto señala la importancia de considerar m6A como el sexto elemento del ADN.
Todo esto fue una vista previa, y ahora intentemos responder a la pregunta principal: ¿qué pasa con la modificación de 6 mA (N6-metiladenina) del ADN? ¿Hay alguna secuencia específica? )) El único trabajo de investigación relacionado con esta pregunta que he visto hasta ahora es la metilación abundante de ADN de 6 mA durante la embriogénesis temprana del pez cebra y el cerdo.
Lo que dicen sobre secuencias específicas relacionadas con la modificación de m6A es: “ Motivos de consenso que contienen 6 mA. Para buscar la preferencia de secuencia de 6 mA, realizamos un análisis de motivos en regiones de pico de 6 mA. Teniendo en cuenta la diversidad de secuencia entre las regiones RE y no RE, dividimos los picos en tres grupos: regiones de repetición simple, otras regiones RE aparte de repeticiones simples y regiones no relacionadas con RE (no RE). Curiosamente, obtuvimos motivos significativos pero también diversos para cada grupo. Por ejemplo, en la etapa 64C (etapa de 64 celdas) las regiones de repetición simple, otras regiones RE y no RE se presentan principalmente con motivos 5 -CACACACA-3, 5 -CCTAGC-3 y 5 -CAGCAG-3, respectivamente ( Fig. 2c). Entre las repeticiones simples, el motivo Tándem CA es el más frecuente, seguido por los motivos Tándem 5 -TCCA-3 y 5 -CCAA-3. Las secuencias de motivos más significativas mostraron recurrencia en todas las muestras de secuenciación (Figura complementaria 7c) y son diferentes de las observadas en un estudio reciente11 “.
Para más detalles puedes seguir estos enlaces
http://www.sciencedirect.com/sci…
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…
Metilación del ADN en la adenina N (6) en células madre embrionarias de mamíferos.
