Solo por curiosidad, ¿qué te hizo hacer esa pregunta? La mayor similitud entre los dos es que se basan en gran parte en la física clásica (es decir, newtoniana). En el caso de MD, esta teoría se aplica a las partículas puntuales, mientras que en los modelos climáticos la teoría se basa en la mecánica del continuo. Como resultado, MD considera las variables primarias de la posición y la velocidad de cada átomo, mientras que las variables primarias de los modelos climáticos suelen ser de varias densidades: masa, velocidad, energía. Como resultado, se utilizan métodos numéricos muy diferentes para resolver cada tipo de problema.
Otra similitud es que ambos requieren alguna entrada adicional de la electrostática. La inclusión de cargas puntuales requiere algunas adiciones no triviales a los códigos MD, mientras que los modelos climáticos necesitan la entrada / salida de energía entre el espacio / sol y la tierra. En ambos casos, esta información adicional es necesaria para obtener respuestas precisas, pero de una forma matemática algo diferente a la base de la física newtoniana. Además, ambos tienen reacciones químicas que se pueden incorporar dentro de ellos, pero en MD esto generalmente implica romper o formar enlaces moleculares, mientras que los modelos climáticos deben rastrear las especies que reaccionan y modelar sus términos fuente asociados.
En mi humilde opinión, lo que es a la vez la similitud más significativa y la diferencia significativa entre estos tipos de simulación es la misma que para toda simulación: cierre. Lo que esto significa es que la forma de las ecuaciones que se plantean no contiene toda la información necesaria para resolverlas y las razones son las mismas en toda la simulación: las condiciones límite nunca se conocen por completo y la información de la física se produce en escalas más pequeñas que las temporales. o la resolución espacial puede, en el mejor de los casos, ser aproximada. Me cuesta pensar en una metodología de simulación física que no encuentre este tipo de problema (algunas simulaciones a escala universal evitan el primero, mientras que algunos cálculos cuánticos muy pequeños evitan el último). Desafortunadamente, debido a que esta información faltante es muy específica para la simulación en cuestión, a menudo no se evitan las similitudes entre los modelos de cierre. En la pregunta que planteó, MD necesita energías potenciales interatómicas, mientras que los modelos climáticos necesitan cierres de turbulencia, coeficientes de intercambio, tasas de reacción química, etc.
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