¿Se han observado mutaciones aleatorias que agregan información al ADN?

Bastante. Mutaciones de novo que agregan información a un genoma (ADN) tanto en el laboratorio como de forma natural. Por azar quiero decir que la información es impredecible y estadísticamente no correlacionada con la supervivencia posterior. La herencia de la información de un organismo que ya la tiene no es una mutación de novo.

La herencia de la información que ya está en el genoma está determinada por la selección, no por la mutación. Por lo tanto, solo hablaré sobre dos formas diferentes de mutación de novo (mutación espontánea), que es impredecible. Hablaré sobre la duplicación y transformación de genes. Existen otras formas de mutación de novo, pero creo que dos ejemplos son suficientes para responder a su pregunta.

Puede estar usando una definición de información diferente a la que yo uso. Algunas personas definen la información solo como algo que agrega funciones al ADN, lo que significa que una característica es útil. Por lo tanto, no descartaré la información que mata al organismo de mi definición de información. No defino la información como conocimiento útil para el organismo. En la forma en que los biólogos y los físicos usan la palabra información, cualquier adición de pares de bases al ADN es una adición de información. Entonces, de lo que hablaré es de mutaciones de novo que agregan pares de bases al genoma, independientemente de si tienen una función.

Las mutaciones de novo novo que agregan información al ADN pueden ser inducidas artificialmente por diferentes mutágenos. Por ejemplo, el químico denominado colina provoca la duplicación de genes y cromosomas en las plantas. Sin embargo, los científicos no pueden predecir qué genes serán duplicados por la colina. Además, estos cambios no están estadísticamente correlacionados con el medio ambiente y la supervivencia inmediata de la planta. Es más probable que los cambios maten a la planta y la ayuden. Hay un gran daño colateral por la aplicación de colina. Por lo tanto, estas mutaciones de novo inducidas por colina se consideran aleatorias.

Los científicos han usado las mutaciones de novo hechas por la colina que se han usado muchas veces para crear nuevas especies de plantas. Los científicos seleccionan entre las mutaciones de novo para plantas que son robustas y útiles para los humanos. La duplicación de cromosomas a veces causa una barrera de reproducción, por lo que la planta no puede cruzarse con su población parental. A veces, la planta mutada puede cruzarse con otra especie con la que no se cruzó previamente. Lea sobre las muchas variedades de triticale, criado con la ayuda de colina. Hay muchas especies de plantas agrícolas y decorativas que se han creado con el uso de colina.

La colina se usaba muy comúnmente para alterar genéticamente las plantas antes de que se inventaran las nuevas técnicas de manipulación genética. Los nuevos métodos de alteración genética al menos permiten guiar la mutación de novo, por lo que no pueden considerarse aleatorios. Las duplicaciones de genes causadas por colina son aleatorias, pero para un detalle. Mutaciones inducidas por colina. SIEMPRE agregue información al ADN.

Los científicos infieren la ocurrencia de la duplicación de genes en las poblaciones, aunque no siempre conocen la causa física de la duplicación. No toda la duplicación de genes es causada por colina. Según la teoría biológica actual, todas las copias de un alelo encontrado en el genoma de cualquier organismo se originaron en la duplicación génica de un antepasado de ese organismo.

Otro tipo de mutación de novo es la transformación. Los organismos a veces pueden absorber fragmentos de ADN en su entorno. Los fragmentos de ADN pueden provenir de un organismo muerto. La absorción puede ser causada por una digestión incompleta. La mayoría del ADN comido por un microorganismo se quema para obtener energía. Sin embargo, una pequeña cantidad de ADN se empalma en el cromosoma del animal mediante un proceso que generalmente se usa en la herencia de ADN.

Este tipo de mutación es aleatoria porque la absorción del ADN es impredecible y no está correlacionada con la supervivencia inmediata del nuevo organismo.

Todos los organismos unicelulares pueden realizar transformaciones con fragmentos de ADN disponibles. Sin embargo, algunos organismos unicelulares realizan la transformación más que otros. Los protozoos llamados dinoflagelados son un transformador campeón.

Los dinoflagelados son un organismo unicelular con una sorprendente capacidad para cambiar de forma. También tienen uno de los genomas más grandes entre todos los organismos. Los biólogos evolutivos a menudo ‘explican’ ambas características en términos de transformación.

Los dinoflagelados tienen un cariotipo inusual (estructura cromosómica) que tiene afinidad por el ADN fragmentado. Por lo tanto, los dinoflagelados tienden a incorporar los fragmentos de ADN en las bacterias que come. Ahora, generalmente no incorpora los fragmentos de ADN. Sin embargo, lo hace una cantidad significativa de tiempo.

Los dinoflagelados incorporan genes de bacterias en sus cromosomas. Cuando un gen de una bacteria se incorpora a su cromosoma, la información sobre el genoma aumenta.

Esto puede explicar por qué el genoma de los dinoflagelados es tan GRANDE. Algunas especies de dinoflagelados tienen un genoma que es 80 veces más grande que el genoma de un ser humano. Esto también explica parte de su capacidad de transformación. La estructura del dinoflagelado cambia cuando cambia el estado de expresión de su genoma. Los dinoflagelados existentes parecen tener una red de genes que corresponde a cada una de sus formas.

Las mutaciones de novo causadas por la transformación son aleatorias. Sin embargo, esas mutaciones de novo que viven lo hacen porque la expresión de algunos alelos los hace aptos para su entorno. Entonces, una combinación de mutación de novo por transformación y selección natural hacen de los dinoflagelados uno de los eucariotas más robustos de la tierra.

Si insiste en usar la función de palabra como parte de la información, entonces no puedo ayudarlo. Por definición, una mutación de novo no puede tener una función. La ‘función’ de un gen surge debido a la selección natural, no a la mutación.

La duplicación y la transformación de genes son ambas ‘variaciones de probabilidad’ en la forma en que Darwin las definió. Creo que Darwin usó la frase ‘variación de probabilidad’ de manera muy parecida a como un físico o químico usaría la palabra ‘mutación aleatoria’. En el estricto sentido bioquímico de la palabra, las dos mutaciones de novo que mencioné son aleatorias.

Dada casi cualquier definición razonable para “agregar información”, la respuesta es sí. Si tienes otros, los agregaré.

  1. Aumentar la cantidad de material genético físico.
  2. La creación de nuevas secuencias y fenotipos.
  3. La creación de un fenotipo beneficioso a través de la creación de secuencias novedosas.

Todos estos se han visto bastantes veces:

  1. Aumentar la cantidad de ADN es realmente bastante fácil. Muchas plantas se han sometido a duplicaciones completas del genoma, lo que resulta en una condición conocida como poliploidía. Esto está muy extendido y es realmente importante para la calidad de muchos cultivos domesticados. Además, tener genes “de reserva” permite que una o más copias muten libremente porque hay al menos una copia de seguridad que produce las proteínas correctas. Esto lleva a la creación de una familia de genes. Este video puede ayudar a explicarlo: Evolución de los genes homólogos
  2. Las nuevas secuencias pueden venir en varias formas. Puede eliminar, sustituir o insertar un nucleótido. Puede copiar secuencias enteras, moverlas o eliminarlas. Incluso puede obtener inserciones de genomas virales completos. Todavía hay más formas, como la combinación de exones y el empalme de intrones, pero lo mantendré simple (Nature Reviews Genetics). Todo esto puede ser beneficioso, dañino o neutral según las circunstancias. Por ejemplo, un estudio a largo plazo sobre E. coli resultó en una población que podía metabolizar el citrato en presencia de oxígeno. Esto se hizo copiando el gen relevante en una secuencia que se reguló de manera tal que estaba activada en presencia de oxígeno. La pérdida de funcionalidad en un gen también puede ser beneficiosa. El gen CCR5 codifica un receptor en los glóbulos blancos que el VIH puede usar para infectarlos. Las personas con dos copias rotas del gen CCR5 son completamente inmunes al VIH (la primera persona que se curó del VIH recibió un trasplante de médula ósea de un individuo así) y su sistema inmunológico funciona bien sin el receptor.
  3. Aquí te dirijo: ejemplos de mutaciones beneficiosas y selección natural. Algunos son duplicaciones, algunos son inserciones de base, otros son eliminaciones. La evolución solo funciona en lo que ya existe, por lo que los genes solo provienen de material genético preexistente. Para obtener un nuevo gen, a menudo duplica uno existente y lo cambia lentamente con el tiempo. Como resultado, aunque encontré toneladas de ejemplos de genes que divergieron hace millones de años y mutaciones beneficiosas “pequeñas”, dudo que haya ejemplos de familias de genes enteras que se formaron durante el siglo pasado. ¿Mejores metabolismos a través de duplicaciones de genes y cambios de bases? Mucho. ¿Evolución de la multicelularidad? Seguro. ¿Creación de nuevas vías metabólicas? Sip. ¿Evolución de las familias / agrupaciones de genes de hemoglobina y hox? Bueno, puedes leer esto, pero eso sucedió hace mucho tiempo:

Evolución de la hemoglobina y sus genes

Evolución de los grupos de genes Hox en deuterostomas

Como dije, si tiene alguna otra definición para “agregar información”, no dude en decirlo. Solo asegúrese de que sea un concepto real con un significado biológico real y objetivo. Y si de alguna manera traes entropía y “orden”, entonces no te molestes.

Si. La duplicación de genes es una categoría importante de tales eventos.

Dicho esto, la “información” es una forma bastante oscura de pensar sobre la genética. Lo que se entiende más fácilmente y es más relevante biológicamente es si hemos visto mutaciones que han llevado a nuevas funciones o rasgos biológicos.

Y nuevamente, la respuesta es: sí.

Un buen ejemplo es la evolución del metabolismo del citrato en la bacteria E. coli . Esta publicación, realizada por uno de los científicos principales, Sobre la evolución del uso de citrato, lleva a eso (ver enlaces en la publicación) y también aborda el reclamo de “no hay información nueva”.

Los autores (de otro artículo) afirman repetidamente (última oración de su declaración de Importancia, y primer y último párrafos de su Discusión) que “no se desarrolló nueva información genética”. Sin embargo, esa declaración contradice rotundamente el hecho de que en sus experimentos y en los nuestros , E. coli adquirió la nueva capacidad de crecer en citrato en presencia de oxígeno. …

La afirmación de que “ninguna nueva información genética evolucionó” se basa en el hecho de que las bacterias ganaron esta nueva capacidad al reorganizar los elementos genéticos estructurales y reguladores existentes. Pero eso es como decir un nuevo libro, por ejemplo, El origen de las especies de Darwin cuando apareció por primera vez en 1859, no contiene información nueva, porque el texto tiene las mismas letras y palabras antiguas que se encuentran en otros libros.

Su pregunta revela cierta ignorancia en las áreas de teoría de la información y biología tanto.

Primero, información. Son las secuencias aleatorias (digamos, de ADN) que necesitan la mayor cantidad de información para su descripción. (Restante después de la compresión; información de Kolmogorov.) Las mutaciones, por lo tanto, agregan la mayor cantidad de información, y un genoma desordenado es, por lo tanto, el que tiene más información. Cuando las secuencias describen información útil (digamos, de genes útiles) son necesariamente menos informativas. (Información del canal; información de Shannon).

Segundo, biología. Estudiar información en el genoma no es una cuestión científica vital, no le informa sobre la biología. Pero para el caso, se ha verificado mediante la observación de que, como se esperaba, la información sobre el medio ambiente se canaliza hacia el genoma, reduciendo su contenido de información general como debería. Pero la selección hace eso, permite que la información de qué alelos fueron útiles para sobrevivir en el entorno de la generación parental se fije [El desafío de la información].

Por lo tanto, podría ver que la teoría de la información y la evolución de la célula tienen los dos mecanismos principales de mutaciones aleatorias que actúan principalmente para aumentar la información y disminuir la información útil, y la selección que actúa principalmente para disminuir la información y aumentar la información útil. Por supuesto que hay excepciones, como siempre en biología. Otros comentarios han señalado duplicaciones de genes, que es una mutación común que también puede aumentar la información útil ya que hace crecer el genoma, y ​​tenemos deleciones que disminuyen la información. De hecho, como la mayoría de la evolución es neutral y alcanzamos fácilmente la saturación de los sitios, la mayoría de las mutaciones no aumentan ni disminuyen la información en el sentido teórico de la información.

Para ser completos, los mecanismos de adición de variación genética son la mutación y la migración, y los mecanismos de pérdida de variación son deriva, endogamia y selección. Elige tu veneno.

Cuanto más larga sea la cadena de ADN, más información puede contener. Tiene una mayor capacidad para almacenar información. Es como un CD, que contiene bits y bytes, mientras que una cadena de ADN contiene caracteres de ADN. No hay una gran diferencia.

Hay varios procesos biológicos que aumentan la longitud de una cadena de ADN “por error”, generalmente cuando se crean los gametos. Por ejemplo, un cromosoma puede unirse a otro, creando uno más largo. Esto no es algo que normalmente sucede. Sucede de vez en cuando.

El feto resultante puede (o no) ser capaz de sobrevivir y tener descendencia con solo una versión “correcta” del cromosoma del otro progenitor. Puede pasar el más largo a su descendencia, etc. Con el tiempo, el cromosoma se modifica de forma aleatoria, mientras que los procesos evolutivos se reducen para optimizar la capacidad de supervivencia. Es más largo que el original, puede contener más información y codificar más genes.

Puede codificar dos versiones del mismo gen en diferentes ubicaciones. Con el tiempo se convertirán en la versión A y la versión B de ese gen, y aún más en el futuro tendrán menos parecido entre sí. Ahora tiene dos genes diferentes en lugar de uno.

Los evolucionistas discutirán sobre lo que significa “nuevo agregado”. La respuesta es no, las mutaciones no aumentan la cantidad de datos en el genoma. Las mutaciones y la expresión génica solo pueden funcionar con información preexistente.

Información y mutación – Respondiendo a David Levin | Noticias de evolución

¿Es la duplicación de genes la respuesta?

Una respuesta al “Reto de información” del Dr. Dawkins (Parte 2): ¿La duplicación de genes aumenta el contenido de la información? (Actualizado) | Noticias de evolución

La forma en que hace la pregunta es fácil de responder sí. Cualquier mutación aleatoria agrega información, y la cantidad de aumento de información es mayor cuanto más aleatorio sea el cambio.

Conceptos erróneos en las teorías de la evolución.