Los mamíferos son sinapsidos [0], un clado que se ramificó temprano (AFAIK durante el carbonífero). En la taxonomía actual, no se consideran reptiles (estos últimos son anápsidos (es decir, tortugas y muchos taxones extintos) y diápsidos (todos los demás reptiles), [1]). Las aves son dinosaurios, es decir, profundamente anidados dentro de los reptiles. Más específicamente, los dinosaurios (incluidas las aves) son archosaurios (junto con los cocodrilos, los reptiles vivos restantes son lepidosaurios).
[0] Los anápsidos, sinápsidos y diápsidos reciben su nombre de su morfología del cráneo (número de agujeros) – wikipedia tiene imágenes.
[1] Con la posición exacta de los anapsidos siendo algo poco clara. Podrían ser una rama temprana (bifurcada de otros reptiles en el pérmico, es decir, después de que las sinapsidas se separaron) o haber evolucionado más recientemente de los diápsidos durante el Triásico.
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Editar: Acabo de mirar http://en.wikipedia.org/wiki/Par…, tienen buenos cladogramas.
Edit2: Debido a descubrimientos recientes (2011), Archosauria ahora está anidada dentro de Crurotarsi (anteriormente crocs + Phytosaurus) [Nesbitt, SJ (2011). “La evolución temprana de los archosaurios: relaciones y el origen de los principales clados”. Boletín del Museo Americano de Historia Natural 352 : 1–292. doi: 10.1206 / 352.1]
