Las adaptaciones transitorias son soluciones evolutivas que surgen pero que se vuelven a seleccionar rápidamente de nuevo. Cuando la presión de selección cambia y una población tiene que adaptarse a nuevas condiciones, el tiempo hasta que se arreglen la mayoría de los alelos recientemente favorables es un período evolutivo transitorio hacia un nuevo óptimo.
Por ejemplo, las duplicaciones de cromosomas en la levadura surgen como respuesta a la presión de selección, pero se eliminan nuevamente con bastante rapidez, incluso si la presión persiste.
En el ejemplo que estaba dando, hablaban sobre el papel del sexo en la respuesta a los cambios evolutivos. Allí, la ventaja del sexo al permitir que los alelos se desempeñen bien en diferentes combinaciones será especialmente relevante en períodos donde las presiones de selección están cambiando y muchos alelos no fijos ocurren en la población. La variación genética es alta en períodos transitorios y disminuirá a medida que ciertos alelos se fijen. En esta fase, es más ventajoso si un alelo puede funcionar bien en combinación con muchos otros. Incluso si fuera beneficioso por sí solo, sería eliminado de la población cuando es perjudicial en combinación, especialmente en los casos en que muchos alelos están presentes en la población y la probabilidad de ser emparejado con un alelo correspondiente es baja.
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Sin embargo, las etapas transitorias de la evolución pueden ser muy difíciles de precisar, porque la evolución en sí misma es un proceso continuo.