Una forma diferente de preguntar esto es “¿hay formas en que el esquema de codificación de 4 pares de bases se filtre en el fenotipo de tal manera que se pueda inferir el esquema de codificación?”
Es posible que la respuesta sea “sí”, pero no sería una inferencia fácil.
Como primera aproximación, la heredabilidad de los rasgos se parece a una “caja negra” a nivel del gen, que ya es una secuencia larga de “código” de ADN. Con los genes que actúan como las unidades combinadas básicas de la herencia, es difícil llegar mucho más abajo que en detalle simplemente analizando estadísticamente los rasgos observables.
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Sin embargo, los genes no son verdaderas unidades independientes. Hay muchas interacciones genéticas que son efectos secundarios del esquema de representación física. Por ejemplo, los genes interactúan de acuerdo con su proximidad física en el ADN. Y aunque normalmente solo un lado del ADN codifica las proteínas (el lado “sensorial”), el lado antisentido también tiene influencias genéticas, y los patrones pueden cambiar de lado en ciertos tipos de mutaciones. ¿Podrían estos efectos indirectos implicar el emparejamiento AT, CG? Además, los fragmentos de ARN también funcionan como mecanismos (enzimas de ARN), por lo que los fragmentos de ADN no siempre necesitan codificar proteínas para tener un efecto en la célula. Y, por último, las mutaciones, que pueden resultar del intercambio de un solo par de bases, podrían de alguna manera revelar la estructura de codificación intrínseca, suponiendo que las proteínas mutantes se secuenciaron. Por ejemplo, un emparejamiento de base 2 tendría diferentes patrones de mutación.
Incluso con todo esto, el esquema de codificación de 4 pares de bases está tan alejado de la expresión del rasgo fenotípico, que es difícil ver cómo uno podría concluir definitivamente 4 bases solo del análisis del rasgo.
