¿Qué porcentaje de ARNm transcrito nunca logra ser traducido por los ribosomas?

Gran pregunta que no estoy seguro ha sido estudiada. Sería técnicamente exigente, pero una forma de pensarlo es que nada es 100% o 0% en biología, por lo que me imagino que la verdad biológica cae en algún punto intermedio.

Dentro de la célula de mamífero, existen muchos métodos diferentes de regulación de ARNm con respecto al inicio de la proteína y la vida media del ARNm. Los ejemplos incluyen la regulación de la actividad de eIF4E y eIF4G, y el reclutamiento de factores en el 3 ‘UTR para promover la degradación. Esto enfatiza que la evolución ha seleccionado formas de prevenir la traducción de ribosomas y la producción de proteínas, como sugiere la pregunta.

Cómo analizar entre esas modulaciones, y el ARNm que nunca se traduce en primer lugar sería difícil. Uno podría medir los niveles de ARNm con RT-PCR, y medir los niveles de proteínas sustitutas con luciferasa, por ejemplo, pero sería difícil saber de dónde provienen las diferencias en la traducción. Un mejor experimento podría inyectar ARNm directamente en el núcleo de Xenopus, y luego observar la exportación y la traducción, pero nuevamente no podría indicar qué fracción no se traduce en absoluto. Quizás se podría agregar algo de Gcap artificial que serían cambios si el ARNm se tradujera, u otros nucleótidos modificados que se cambian de alguna manera con la traducción. Eso podría responder a su pregunta con una lectura específica de ARNm traducido versus no traducido.

no todo el ARN codifica proteínas, la mayoría del ARN (hasta el 95%) es ARNt + ARNt + otros ARN pequeños. Por lo tanto, no hay un gran porcentaje de codificación de ARN para empezar. También existe todo el ARN que nunca se exporta desde el núcleo, ya que contiene errores y lo mismo en el citoplasma si se ha degradado y debe eliminarse. El ARN eucariota que codifica la proteína y se etiqueta para exportarlo para que se traduzca, en general, no “ flota en el citoplasma ” al menos durante mucho tiempo y hasta después de que se ha traducido al menos una vez. Cuando el ARNm empaquetado se exporta a través de los poros fuera del núcleo, se ‘dirige’ y no se libera. Normalmente, cuando el extremo 5 ‘del ARN ingresa al citoplasma, se liberan varios factores de exportación del ARN y se unen nuevas proteínas citoplasmáticas que permiten la formación de ribosomas y luego el inicio de la traducción. Gran parte de esto ocurre en los pliegues complejos de la sala de emergencias directamente fuera del núcleo (lo cual es necesario para que las proteínas puedan procesarse hasta la madurez dentro de la EER), por lo que hay poco ‘flotación’.

¿Qué porcentaje de ARN codificantes exportados con éxito no son capturados por los ribosomas cuando salen del núcleo? No tengo idea, pero en una célula eucariota sana tendría que ser bastante baja. De los ARN que ya se han traducido, cuántos flotan libremente y cuántos luego se ‘recapturan’ para su traducción … de nuevo, no tengo idea, pero creo que aquí es donde entran en juego los problemas que mencionó de probabilidad y ubicación. También debería tener en cuenta la vida media del ARN. Probablemente todavía sería un pequeño porcentaje del ARN codificante.