La mejor colaboración científica de la que formé parte fue de beneficio mutuo para ambas partes, resultó en un puñado de publicaciones y al menos una beca de investigación, y condujo a una relación duradera entre los IP del laboratorio y entre mi colaborador y yo, Jimmy.
Aproximadamente 2 años después de mi trabajo de tesis, mi asesor de tesis, William Murphy en el departamento de ingeniería biomédica, fue contactado por un posible colaborador, Samuel Gellman en el departamento de bioquímica, sobre una idea. El estudiante de Sam tenía un proyecto que involucraba explorar diferentes variaciones de una secuencia de péptidos para mejorar su actividad biológica basada en relaciones estructura-función conocidas con el péptido. Sus péptidos fueron hipotetizados para modular el proceso de angiogénesis o crecimiento de los vasos sanguíneos. El estudiante de Sam no estaba bien versado en ensayos biológicos, por lo que Sam inició una conversación con nuestro laboratorio sobre cómo aprovechar la experiencia de nuestro laboratorio con ensayos de angiogénesis in vitro. Estuvimos de acuerdo y nos fuimos a las carreras a probar sus péptidos. Me pusieron en el proyecto, ya que participé activamente en el uso y desarrollo de ensayos de angiogénesis en el laboratorio. El proyecto fue ligeramente exitoso, pero destacó para el laboratorio de Sam que efectivamente teníamos una especialización en ensayos de angiogénesis, y Sam se acercó a nosotros con otra idea de proyecto con su estudiante, James Checco, quien quería hacer una pasantía en nuestro laboratorio el verano siguiente. para probar una hipótesis que terminó formando la base de su proyecto de tesis.
James y yo nos llevamos bien durante el verano, y realizamos docenas de experimentos para probar sus péptidos en nuestros ensayos biológicos. Los datos que generó ese verano constituyeron un componente clave de un artículo que escribió y publicó en una de las principales revistas de nuestro campo, PNAS:
- ¿Cuál es el proceso para la investigación científica?
- ¿Qué tan difícil es ser innovador en física teórica?
- ¿Qué hago si alguien roba mi investigación científica (o cualquier otro tipo de investigación) y la vende?
- ¿Cuáles son algunos de los principios científicos intuitivos contrarios más intrigantes?
- ¿Cuáles son los principales hilos teóricos de la metodología de investigación?
Dirigido a diversas interfaces de interacción proteína-proteína con péptidos α / β derivados del andamio del dominio Z
Jimmy estaba encantado con los resultados que pudo generar en nuestro laboratorio, y varios meses después, regresó a nuestro laboratorio pidiendo ayuda con otro proyecto no relacionado. Quería explorar un tipo diferente de ensayo biológico y probar otra hipótesis relacionada con su documento PNAS. El desafío era que este segundo proyecto no estaba relacionado con la angiogénesis, y necesitábamos desarrollar nuestro propio ensayo basado en otros artículos publicados para probar su hipótesis. Jimmy tenía confianza en nuestro laboratorio basado en su pasantía el verano anterior, y planeamos nuestros experimentos para un mes o dos antes de comenzar. La colaboración nuevamente fue un éxito masivo, y generamos toneladas de imágenes que abordaron directamente su hipótesis, y fueron piezas importantes de información que respaldaron sus otros hallazgos. La colaboración condujo a otra publicación en JACS.
Figura: Mi imagen favorita generada a partir de mi colaboración con el laboratorio de Gellman, que muestra un fibroblastos embrionarios de ratón con péptido penetrante celular (teñido de verde) en el citoplasma. El núcleo se tiñe de azul y la membrana celular se tiñe de rojo. La barra de escala representa 20 um.
Foldamers de péptido α / β dirigidos a interacciones proteína-proteína intracelulares con actividad en células vivas
En general, puede parecer que la colaboración fue unilateral, pero la experiencia que compartimos con el laboratorio de Sam Gellman fue recíproca. Nuestro laboratorio también participó en la síntesis de péptidos, por lo que confiamos en la experiencia de Sam para ayudarnos con algunos de nuestros proyectos. Afortunadamente, los datos que generamos con la ayuda del laboratorio de Jimmy y Sam se incorporaron a una exitosa renovación de subvención NIH R01 (Información del proyecto). Esos estudios están en curso, pero una parte importante de ese esfuerzo fue motivada por datos que el laboratorio de Sam nos ayudó a generar.
Jimmy y yo nos mantenemos en contacto, y me atrevo a decir que forjamos un poco de amistad basada en nuestra colaboración. En general, creo que la colaboración fue mutuamente beneficiosa para ambos laboratorios involucrados, y la experiencia compartida y aprendida a través de nuestras colaboraciones iniciales conducirá a muchos más proyectos de colaboración en el futuro.