La “medicina basada en la evidencia” difiere de la “medicina convencional” en que una cantidad sorprendentemente grande de medicina convencional se basa en la intuición, las conjeturas y la anécdota (incluida la experiencia personal). La medicina es un campo enorme, y muchos de sus supuestos no han estado sujetos al mismo escrutinio que las nuevas afirmaciones médicas.
En muchos casos, la MBE es idéntica a la medicina convencional: se utiliza lo que se ha demostrado que funciona. Pero cuando falta evidencia o es controvertida, no siempre es posible practicar EBM.
EBM es generalmente bienvenido por los médicos, quienes lo ven como una formalización de lo que ya estaban haciendo. Algunos se oponen cuando la evidencia reunida en entornos de laboratorio, o clínicas experimentales estandarizadas, difiere de su experiencia, especialmente su conocimiento de la historia de un paciente en particular. El efecto es una tensión entre la evidencia y los juicios del médico.
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