Aunque hay mucho nitrógeno en el aire, no está en una forma que las plantas puedan usar. Solo pueden absorber nitrógeno en forma de amonio, nitrito y nitrato. Una forma en que las plantas tienen acceso a estas formas de nitrógenos es la descomposición de la materia orgánica por los organismos del suelo. Otra fuente de nitrógeno utilizable son las relaciones mutualistas entre plantas y bacterias. Al proporcionar a las bacterias fijadoras de nitrógeno un lugar para vivir y alimentarlas con carbohidratos, las plantas obtienen nitrógeno en forma de amonio. Las plantas que pueden hacer esto incluyen la mayoría de las legumbres que forman relaciones con la bacteria Rhizobium y otras plantas como el aliso, el arándano, la lila de California y la aceituna rusa que apoyan la bacteria Frankia en sus raíces.
También hay bacterias libres de fijación de nitrógeno, así como cianobacterias que crecen en la superficie de las plantas o en el suelo, que agregan pequeñas cantidades de nitrógeno utilizable por las plantas al suelo. Los rayos también generan compuestos de nitrógeno utilizables.
El fertilizante químico es una fuente importante de nitrógeno utilizable por las plantas. Pero otras actividades humanas, como la quema de combustibles fósiles y las operaciones ganaderas, producen inadvertidamente lluvias enriquecidas con nitrógeno.
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