Tu pregunta es buena. En realidad, es una de las principales respuestas que aportó Darwin, a pesar de que no entendía bien los mecanismos (los mecanismos se entienden mucho mejor hoy), pero está mal cubierto por gran parte de la enseñanza sobre la evolución.
La mayor parte de la evolución consiste en la variación más la selección (así es exactamente como lo expresó Darwin: su “teoría de la descendencia con modificación a través de la variación y la selección natural”). Su pregunta es: ¿Cuál es esta variación a partir de la cual se construye la selección? Parece que se da por sentado en muchos textos básicos, pero Darwin lo enfrentó de frente.
A principios de 1800, esto puede haber sido un problema aún mayor que hoy, ya que había un concepto bastante formal de “especie tipo”. La idea era que existe una esencia natural de una especie, y la variación de esa esencia era menor y no era de mucho interés.
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Pero aquí están los títulos de los primeros capítulos de Darwin de Origin of Species:
CAPÍTULO I. VARIACIÓN BAJO DOMESTICACIÓN
CAPITULO DOS. VARIACIÓN BAJO LA NATURALEZA
CAPITULO III. LUCHA POR LA EXISTENCIA
CAPITULO IV. SELECCION NATURAL; O la supervivencia del más apto
CAPÍTULO V. LEYES DE VARIACIÓN
Tres de sus primeros cinco capítulos, y sus dos primeros capítulos, que sentaron las bases de su argumento, tienen que ver con la variación.
Él entendió que para que la selección natural funcione, absolutamente tiene que haber una reserva de variación dentro de una especie. Su teoría no funcionaría con el concepto de una esencia platónica de especies con una variación mínima. Su observación fue que, dentro de cualquier especie, hay una gran cantidad de variación para comenzar. En esos capítulos, proporciona un ejemplo tras otro de la variación masiva dentro de las especies, utilizando ejemplos diarios comunes que serían familiares para sus lectores, para resolver esa primera y más mortal objeción.
Aquí está parte de su “recapitulación”, al final de su libro:
Bajo domesticación vemos mucha variabilidad, causada, o al menos excitada, por condiciones cambiantes de la vida; pero a menudo de una manera tan oscura que nos sentimos tentados a considerar las variaciones como espontáneas. La variabilidad se rige por muchas leyes complejas, por el crecimiento correlacionado, la compensación, el mayor uso y desuso de piezas, y la acción definitiva de las condiciones circundantes. … Por otro lado, tenemos evidencia de que la variabilidad, cuando alguna vez ha entrado en juego, no cesa bajo la domesticación por un período muy largo; ni sabemos que nunca cesa, ya que nuestras nuevas producciones domesticadas todavía producen ocasionalmente nuevas variedades.
La variabilidad no es realmente causada por el hombre; él solo expone involuntariamente a los seres orgánicos a nuevas condiciones de vida y luego la naturaleza actúa sobre la organización y hace que varíe.
Puedes ver la importancia que le dio a este concepto.
Entonces, está claro, durante al menos 150 años, que hay una gran reserva de variabilidad física dentro de las especies. De donde viene eso? Esa es una pregunta que Darwin no pudo responder (“La variabilidad se rige por muchas leyes complejas “) porque no sabía nada de genética. Sin embargo, lo que sabemos ahora es que la variación surge de mutaciones aleatorias.
¿Qué tan comunes son las mutaciones? Resulta que en realidad son bastante comunes. Por ejemplo, cada humano tiene alrededor de 100 nuevas mutaciones dispersas en todo su genoma. Es un estadio razonable para casi cualquier organismo complejo, incluidos los pinzones de Galápagos.
La mayoría de esas mutaciones van a ser silenciosas. La mayoría del resto será dañino, porque los pinzones ya están bastante bien adaptados y es probable que cualquier cambio sea dañino. Sin embargo, hay un suministro constante de nuevas variaciones que ingresan a las poblaciones cada generación, y que se suman al conjunto de variaciones restantes de las generaciones anteriores. Si la población de pinzones es, no sé, 10,000 aves, entonces potencialmente hay un millón de variantes genéticas que ingresan a la población cada generación. (Obviamente, hay muchos calificadores en eso, pero ya ves el punto).
Hay mucho más que eso, pero está el resultado final. Cuando pensamos en un pinzón de Galápagos, pensamos en “un pinzón de tierra medio”, así: 
Pero el hecho de que solo veamos una foto de ellos no significa que se vean así. No hay tal cosa como “un” pinzón de tierra mediana. Cada uno de ellos es diferente: D color diferente, tamaño diferente, forma de pie diferente, patrones de plumas diferentes, tamaño de pico diferente, como resultado de la mutación y variación pequeñas acumuladas a lo largo de las generaciones.
