La investigación realizada en las estaciones de Investigación Ecológica a Largo Plazo (LTER) cubre casi todas las cuestiones fundamentales de la ecología. Pero como su nombre lo indica, el énfasis está en estudios a largo plazo que rastrean fenómenos ecológicos durante años o décadas.
Mapa del sitio LTER 
Es un objetivo importante determinar en qué medida los patrones ecológicos que observamos pueden generalizarse. Queremos saber: ¿De qué maneras fundamentales son similares los desiertos, arroyos, bosques y océanos? Claramente, son bastante diferentes en las formas que afectan cómo debemos conservarlos y utilizar sus servicios de manera sostenible. [1] Pero para comprender estas preguntas, tenemos que probar muchos de los mismos tipos de experimentos en diversos entornos, que es una función de los sitios LTER.
- Ecología: ¿Las aves se ven menos afectadas por hábitats fragmentados que los mamíferos / reptiles?
- ¿Qué es la ecología humana y cuáles son sus aplicaciones en la sociedad?
- ¿Cuáles son algunos de los peligros que enfrentan los humedales?
- ¿Qué pasaría si no hubiera algas en los océanos?
- ¿Cómo podría el nombramiento de Scott Pruitt como jefe de la EPA afectar el medio ambiente?
Pero la mayoría de los sitios LTER también tienen bastante investigación específica del sitio, y algunos sitios se han vuelto particularmente conocidos por ciertos experimentos. Por ejemplo:
- Cedar Creek LTER en Minnesota es el hogar del famoso trabajo experimental de David Tilman sobre la relación de la función biodiversidad-ecosistema
- Northern Temperate Lakes LTER en Wisconsin ha tenido un gran trabajo sobre las redes alimentarias del lago y el ciclo de nutrientes, y los efectos del desarrollo (especialmente las casas de vacaciones) en estas propiedades
- Konza Prairie LTER en Kansas es donde se han realizado muchas de las mejores investigaciones sobre los efectos de las quemaduras prescritas y el pastoreo de animales en la salud de las praderas
- Arizona Central-Phoenix LTER y Baltimore Ecosystem Study LTER, en Arizona y Maryland, respectivamente, son dos de los sitios más destacados para la ecología urbana. Y debido a que Phoenix es una ciudad desértica, el CAP LTER es crucial para comprender cómo el desarrollo afecta la hidrología del desierto
Durante las temporadas de campo, los LTER a menudo tendrán múltiples equipos de campo trabajando en una variedad de proyectos. El programa en su conjunto ha sido muy productivo al proporcionar datos para responder a todo tipo de preguntas ecológicas.
Manipulaciones de la biodiversidad en Cedar Creek 
[1] Vea esta publicación de Jeremy Fox sobre la cuestión de la generalidad frente a la contingencia en ecología: ‘Sintetizar la ecología’: volver a visitar un clásico de Oikos
