A veces puedes deducirlo teóricamente: si conoces la química involucrada y sabes para qué proteínas están codificadas, puedes intentar averiguar qué proteínas son las más importantes para el fenotipo que estás estudiando. Algo como la pigmentación puede reducirse a cosas simples como los genes que codifican la melanina y cuántas copias tiene.
También existe la fuerza bruta: modifique los genes en un organismo (preferiblemente uno con una tasa de reproducción rápida y una vida útil corta, como bacterias o moscas de la fruta) y vea qué cambia fenotípicamente. Por lo general, tenemos una mejor idea que la “fuerza bruta” para reducir el área en la que queremos intentar hacer cambios, pero técnicamente es una opción.
Una tercera opción es estudiar la correlación. No necesariamente obtendrá la respuesta correcta dependiendo de la población que esté estudiando, pero si puede comparar muchos genomas de personas / animales fenotípicamente similares pero distintos, comenzará a ver qué se correlaciona genéticamente con qué fenotipo, y cuál es el significado de cada correlación. por ejemplo: si todas las personas con cabello negro tienen el gen x en el cromosoma z, esto puede ser indicativo de la influencia del gen x en la promoción del fenotipo del cabello negro.
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Probablemente hay otras formas, pero esas son tres en las que he pensado.
