¿Qué tan rápido está actualmente mutando el Ébola?

El análisis de Ian York es correcto, basado en la última información disponible. La estimación de la tasa de sustitución del artículo de Science (Gire, et al. Science 2014: la vigilancia genómica aclara el origen y la transmisión del virus del Ébola durante el brote de 2014) es un poco preocupante, más en la línea de un virus de influenza A (Nobusawa, JVI 2006: Comparación de las tasas de mutación de los virus de la influenza humana A y B, y otros estudios).

Tasa de mutación del virus del Ébola: Desafortunadamente, actualmente, se desconoce la variación de secuencia (mutación) presente en la población en la cepa actual del brote en África occidental. La razón es que este virus del Ébola ha infectado (transmitido) en serie a los humanos durante posiblemente 10 o más generaciones, y ha tenido miles de oportunidades para la selección in vivo desde principios de 2014. ¿Para qué variantes se han seleccionado los humanos de forma continua? passaging? A menos que comencemos a secuenciar como locos, no lo sabemos.

¿Cuáles son las posibilidades de que surja, o ya exista, una variante de secuencia que haya alterado la patogenicidad, los modos de transmisión, el tropismo de los tejidos (tipos de células que infecta el virus), las características epidemiológicas o los mecanismos de evasión inmune?

Mantenga la secuencia: la secuencia continua de la variación del virus (mutación) es algo que nos falta en la respuesta a este brote. Sé que es un llamado difícil dedicar tiempo y energía a la investigación, dado lo agotados que son los recursos solo para la respuesta básica de salud pública. Como mínimo, puede decirle algo sobre qué tan bien funcionan sus diagnósticos, la susceptibilidad potencial a los antivirales e informar el diseño de la infección experimental por el virus del Ébola en animales de laboratorio en instalaciones de alta contención (Nivel de bioseguridad BSL 4) para comprender la patogenicidad.

8 × 10 ^ −4 sustituciones por sitio por año. [1]

Más precisamente, eso es lo rápido que el linaje del Ébola de África Occidental está acumulando mutaciones. Presumiblemente, los virus están mutando a un ritmo más o menos constante, pero la gran mayoría de las mutaciones son fuertemente negativas y se seleccionan en contra. Lo que queda son mutaciones ligeramente neutrales, neutrales y positivas, que no se seleccionan contra (y se acumulan aleatoriamente), o que se seleccionan positivamente.

Esta es una tasa bastante alta de sustituciones, incluso para los virus de ARN, que mutan rápidamente. Es aproximadamente el doble de lo que mostró el ébola entre brotes.
Sin embargo, no es una tasa sin precedentes, y es lo que se espera de los brotes de enfermedades virales, donde la cantidad total de virus aumenta rápidamente, porque la rápida expansión permite hacer autostop de mutaciones neutrales e incluso negativas.

No se sabe cuál de las mutaciones, si es que hay alguna, es adaptativa, es decir, si algunas de las mutaciones están permitiendo que el virus se replique o se transmita mejor en humanos. La epidemiología dice que el virus no ha cambiado, que es el resultado final.

El documento del que se toma esto [1] es de acceso abierto, por lo que puede leerlo usted mismo, si lo desea.


1. La vigilancia genómica aclara el origen y la transmisión del virus del Ébola durante el brote de 2014

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