Sí, estoy de acuerdo con Sang Young Noh a continuación, depende enormemente de qué tipo de simulación se está ejecutando.
En el mundo de la simulación de proteínas, todavía no estamos en la longitud de onda del tamaño de la luz (> 400 nm). Sin embargo, esto probablemente no esté tan lejos.
Menciones honoríficas a dos grupos específicos:
- ¿Cuál es el modelo atómico de Rutherford?
- ¿Cuáles son algunos libros o libros de texto de física / matemática / química de la era de la URSS?
- ¿Qué significa 'momento' en momento magnético y momento dipolar?
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1. Mark Sansom y sus simulaciones de grano grueso de una partícula del virus de la gripe en una membrana de mamífero (~ 120 nm). Con partículas> 10 M es bastante grande, y actualmente se encuentra en un impresionante microsegundo de tiempo de simulación.
Enlace al artículo: Ganadores del concurso The Science Behind the Image: Virus de la influenza A y modelos de membrana de plasma de mamíferos
2. El grupo Klaus Schulten que sigue empujando los límites superiores del tamaño de la simulación atomística, por ejemplo, una simulación de 2.7 millones de átomos de un ribosoma unido al canal Sec (~ 50 nm de ancho)
Puede descargar un pdb aquí: Banco de datos de proteínas RCSB
Entonces, espero que no pase mucho tiempo antes de que podamos simular en la escala de la longitud de onda de la luz, por ejemplo, una mitocondria completa.
Referencias
Reddy T, Shorthouse D, Parton DL, et al. Nada para estornudar: un modelo computacional dinámico e integrador de un virus de influenza A Estructura. 2015; 23 (3): 584-597.
Gumbart J, Trabuco LG, Schreiner E, Villa E, Schulten K. Regulación del canal conductor de proteínas por un ribosoma unido. Estructura. 2009; 17 (11): 1453-1464.
