El principal problema que veo al usar la cadena de codificación como plantilla para la transcripción es la de los codones de parada. Los complementos inversos de los codones de 3 paradas UAA , UAG y UGA son UUA , CUA y UCA respectivamente. Si vamos a utilizar la cadena de codificación como una cadena de plantilla, la cadena de plantilla no puede tener estos tres codones o al menos tener muy pocos de ellos. De lo contrario, las secuencias aa de la cadena de codificación serían muy cortas. Estos tres codones codifican para leucina, leucina y serina respectivamente. Recuerde que la leucina y la serina son dos de los aminoácidos más abundantes.
Pero, hay una trampa. Tanto la leucina como la serina tienen 6 codones, cada uno de los cuales significa que incluso si eliminamos 1 o 2 de los codones, todavía tendríamos 4 opciones que podemos usar y teniendo en cuenta que la mayoría de los organismos tienen un sesgo de codón para 1 o 2 de estos 6 codones, este problema se puede resolver fácilmente. Entonces, esto puede suceder.
Pero, el objetivo de tener dos cadenas de ADN es tener dos copias de la misma información genética para que, si una de las copias está dañada, se pueda usar la otra. El uso de ambas cadenas para la transcripción podría conducir a un aumento en el número de genes mutados.
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Ahora, en lo que respecta a la investigación previa, no pude encontrar ninguna para apoyar la hipótesis. Pero, hubo algunos documentos sobre el papel que desempeña la cadena sin plantilla en la transcripción. Parece estar involucrado principalmente en la terminación o prevención de la terminación.
[1] La derivación de la ARN polimerasa de T7 de grandes huecos en la cadena de plantilla revela un papel crítico de la cadena sin plantilla en el alargamiento
Los científicos de Emory descubrieron que la cadena sin plantilla en su experimento en realidad estaba jugando un papel hasta ahora oculto pero crucial en el proceso de transcripción. La polimerasa que usaban, la ARN polimerasa del bacteriófago T7, pudo evitar los huecos en la cadena de ARN de la plantilla y continuar el proceso de alargamiento al unirse a la cadena de ADN sin plantilla y usar esta cadena para tirar de la cadena de la plantilla en la parte de La polimerasa que produce ARN. Sin ambas cadenas de ADN, la cadena no podría continuar extendiéndose y la transcripción se habría detenido.
[2] Papel del filamento sin plantilla de la burbuja de alargamiento en intrinas …