Como Tom Quetchenbach ya ha dicho, la endogamia es la reproducción sexual entre individuos relacionados. Sin embargo, dado que todos estamos relacionados de alguna manera, los genetistas definen la endogamia de manera más técnica y cuantitativa. También quiero discutir los efectos de la endogamia con más detalle. Existe una suposición común de que “la endogamia es siempre mala”, lo cual está lejos de la verdad.
La medida habitual para la endogamia es el coeficiente de endogamia (F). Es una medida de la probabilidad de que dos alelos en un locus dado sean idénticos por descendencia o, en otras palabras, homocigotos. Del mismo modo, también es la proporción del genoma que es homocigota. (Muy estrictamente hablando, las tres cosas que he descrito son en realidad un poco diferentes, pero para la mayoría de los propósitos, pueden entenderse como sinónimos).
Para poner un número en la endogamia y estimar F, el primer paso para establecer una línea de base . La línea de base es lo que considera no relacionado. Por ejemplo, en la mayoría de las poblaciones humanas, dos extraños son primos del sexto al octavo, por lo que podría considerar que no están relacionados; en otros casos, solo usaría tanta información de pedigrí (árbol genealógico) como tenga disponible, y su línea de base se establece por los datos que tiene a mano. Esto es importante porque ~ 99.5 de nuestros genomas humanos son idénticos y, por lo tanto, homocigotos si se consideran loci no variables (es decir, no polimórficos). Sin embargo, establecer esa línea base efectivamente hace que el 99.5% no tenga interés; solo nos interesa el 0.5%.
El coeficiente de endogamia se estima por varios medios, más tradicionalmente a través de simples pedigríes con las matemáticas basadas en los principios mendelianos. Sin embargo, las estimaciones basadas en pedigríes no son un reflejo perfecto de lo que realmente sucede en nuestros genomas. En los tiempos modernos, los “coeficientes de endogamia realizados”, que son más precisos, pueden estimarse más directamente la endogamia en función de nuestra genética (aunque esto conduce a algunos resultados funky como coeficientes de endogamia por debajo de 0 y por encima de 1 – la explicación simple de esto se debe a la línea de base y la escala).
La endogamia es lo más importante debido a la depresión por endogamia . Como hay muchos ejemplos de esto, se entiende simplemente como el aumento en la probabilidad de que obtenga dos alelos recesivos perjudiciales de, digamos, una enfermedad genética importante. Sin embargo, esto también funciona en muchos otros genes (loci) de efectos más pequeños. La aptitud física generalmente disminuye con la depresión endogámica.
Sin embargo, la endogamia no siempre es mala . Los animales superiores tienen una tolerancia muy baja a la endogamia, pero la endogamia es común en otras formas de vida como ciertos gusanos, y extremadamente común en el mundo vegetal. Y en estos casos, estoy hablando de selfing, que, para los estándares humanos, es una forma extrema de endogamia.
La endogamia tiene muchas ventajas, pero se puede reducir a:
1. Las mismas ventajas de la reproducción asexual sobre el sexo, que son numerosas. Estos incluyen una reproducción mucho más rápida y eficiente, menores costos de búsqueda, mejor selección de parentesco, variabilidad no deseada durante generaciones y menor riesgo de enfermedad.
2. Incremento de la frecuencia y / o fijación de los alelos deseados. De la misma manera que los alelos deletéreos tienen más probabilidades de ser desenmascarados, puede arreglar los alelos deseados y purgar esos alelos deletéreos de manera más efectiva.
En promedio, esto no funciona bien en especies con alta depresión endogámica, pero con selección y poblaciones suficientes, los problemas pueden superarse. Esto lo hacen comúnmente los criadores de animales y plantas.
En la cría de animales y plantas, nos enfocamos en rasgos específicos, y tiene sentido que la cría parecida a similar (que intuitivamente estará más relacionada) es una buena estrategia. Como lo describen los criadores de animales, “es un mejoramiento lineal cuando funciona, es endogamia cuando no funciona”. En el fitomejoramiento, también lo hacemos para establecer la uniformidad mediante la liberación de endogámicos de línea pura como variedades, y de manera algo irónica, usándolos como padres para híbridos uniformes.
