¿Existen herramientas en línea para visualizar el grado de similitud genética entre las diferentes especies?

La bioinformática es una disciplina científica rigurosa que simplemente no puede navegar en un navegador web y comenzar a jugar si es un novato total. Existen muchas herramientas en línea de bioinformática en línea para comparar genes, proteínas, piezas coherentes de genes / protiens (“motivos”), grupos de genes / proteínas, etc. y más herramientas para clasificar las relaciones filogenéticas. En su mayoría, estos son difíciles de usar si no sabes lo que estás haciendo, y en su mayoría no hacen lo que estás pidiendo. Stuart Rawson publicó en este hilo información agradable sobre herramientas web alojadas por el Instituto Europeo de Bioinformática. Estos son cada vez más fáciles de usar todo el tiempo, en términos de interfaz de usuario, pero en general estas herramientas no responden a su consulta: son excelentes para comparar genes entre especies pero no para comparar la relación de especies . – y si no puedes entenderlos, no llegarás muy lejos.

Para eso necesita otras herramientas, como SynView, que he visto en funcionamiento, y otra a la que he hecho referencia llamada Sybil . Afortunadamente, los científicos tienden a publicar herramientas útiles libremente para que otros las usen. Estos programas no solo comparan genes a través de diferentes especies y muestran su “distancia evolutiva” sino que también compara GENOMOS ENTEROS. Ese tipo de análisis le dará las respuestas que está preguntando, pero aún tendrá que usar las herramientas EMBL o NCBI para descargar los datos genómicos sin procesar en primer lugar.

Lea esto sobre SynView … si no puede entender eso, no va a llegar muy lejos:
http: //bioinformatics.oxfordjour…
Página en oxfordjournals.org
El programa está alojado aquí para descargar:
http://eupathdb.org/apps/SynView/
SynView :: Guía del usuario
(haga clic en las capturas de pantalla)

Lea esto sobre Sybil
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubm…
Sybil: métodos y software para comparación y visualización de genomas múltiples.
El programa está alojado aquí para descargar:
http://sourceforge.net/projects/…
sybil

Pruébalo y buena suerte!

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