Bicicletas
A menudo aparece como un titular sensacionalista: “los científicos no saben cómo funcionan las BICICLETAS”. Pero eso es un poco incorrecto. Sabemos exactamente cómo podrían funcionar las bicicletas, pero no exactamente cuánto de cada uno de los diversos mecanismos está contribuyendo a que funcione.
El cerebro, y cualquier cosa que involucre la conciencia
Sigue siendo un problema difícil de resolver. Necesita un equipo mucho mejor, y para que la ética mire para otro lado.
Stonehenge y otros logros antiguos
Sabemos que los humanos los construyeron, pero no podemos determinar exactamente cómo lograron estas hazañas dada la tecnología de la época. Desafortunadamente, la evidencia histórica disminuye con el tiempo, por lo que algunos misterios pueden nunca resolverse.
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Vida
Sabemos que funciona, pero aún estamos trabajando en crear vida artificial. Acercándose sin embargo.
El efecto placebo (y nocebo, y otros efectos relacionados)
Sabemos que existe, sabemos que funciona, pero es difícil precisar los mecanismos exactos. Sin embargo, nuestra comprensión de esto está mejorando, pero sigue siendo un desafío para los científicos realizar estudios controlados con placebo en … placebos. (obligatorio xkcd): 
Entrelazamiento cuántico
Tenemos muchas hipótesis, cuál es la correcta (o ninguna), aún está por verse.
Imanes
¿Cómo funcionan el trabajo? Es broma, sabemos cómo funcionan los imanes.
