El problema que discute es un poco solucionable en bioinformática, por lo que se trata. Con leve me refiero a que diversos métodos tienen dificultades pero obtienen una respuesta útil en suficientes casos.
La replicación difiere entre procariotas y eucariotas. Los procariotas tienen generalmente un cromosoma de ADN principal circular con un único origen de replicación. Por lo tanto, ese cromosoma puede iniciar dos horquillas de replicación, que tienen que terminar aproximadamente a la mitad. (Existe una fuerte selección de purificación contra los cambios, por lo que puede descargar y estudiar tales genomas donde los cruces son * muy * simétricos). La replicación rápida es posible, de modo que E. coli pueda comenzar nuevas horquillas de replicación antes de que los cromosomas se separen en las células hijas ; El proceso puede tomar 20 minutos en condiciones de alto contenido de nutrientes.
Los eucariotas, como los humanos, con sus cromosomas lineales masivos, comienzan con 10 de 1000 de horquillas de replicación por cromosoma para poder replicarse en cuestión de horas. Si no recuerdo mal, se puede ver que un 10% de cientos de miles de orígenes de replicaciones están activos en un momento dado, probablemente porque el mecanismo de replicación requiere mucha energía. (Energía para hacer las proteínas del mecanismo en primer lugar, para sintetizar nucleótidos y para colocarlas en las copias de ADN). Hasta donde yo sé, los orígenes de las replicaciones son aleatoriamente activos, controlados por la difusión de las proteínas del mecanismo de replicación, pero puede haber preferencias de acuerdo con la forma en que los cromosomas se desenredan del empaque habitual para permitir la replicación (ver los ciclos celulares de mitosis y meiosis).
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