¿Qué importancia tiene la relación de absorbancia UV de 260/230 nm de muestra de ADN para los procedimientos de secuenciación de Sanger?

Si está utilizando ADN que se extrajo utilizando los métodos comunes basados ​​en filtros, es posible que esté obteniendo un pico alto de 230 debido a la contaminación con sal de guanidinio. Las sales de guanidinio se usan en kits de extracción de ADN basados ​​en filtros para lisar las células y permitir la unión del ADN al filtro de sílice. Son caotrópicos e interferirán con la función normal de la proteína si están presentes en el ADN eluido.

Una buena lectura de 260/230 es ~ 2.0 +/- 0.5 y cuanto más se desvíe de eso, mayor será la probabilidad de que su Sanger falle debido a las impurezas. Sanger puede ser muy sensible a los agentes caotrópicos.

La mejor manera de resolver este problema es hacer un lavado adicional con el tampón de lavado. Por lo general, el tampón de lavado viene en exceso de todos modos, por lo que esto no debería ser un gran problema.