Las especies apomícticas son un gran problema para los taxonomistas de plantas. La apomixis es el proceso por el cual una flor genera semillas sin fertilización por polen (aunque el polen es necesario para inducir el desarrollo de la semilla, no interactúa sexualmente con los gametos femeninos). Las semillas producidas de esta manera son genéticamente idénticas al progenitor, perpetuando un linaje clonal que no interactúa de ninguna manera con sus conespecíficos. Por lo tanto, cada linaje clonal puede considerarse virtualmente como una especie independiente, pero en la práctica, no se puede evaluar el número exacto de linajes utilizando criterios morfológicos clásicos. Requeriría una investigación genética sistemática, que es costosa, requiere mucho tiempo y es de relevancia cuestionable.
Este es uno de los pocos casos en los que es obvio que el concepto de “especie” es arbitrario y varía mucho de un autor a otro. Por ejemplo, Flora Gallica (el libro más reciente sobre flora francesa) da “de 60 a 2000 especies, dependiendo de los autores” para el único género Taraxacum (diente de león).
Algunas otras plantas apomícticas son el género Rubus (mora), Alchemilla (manto de dama), Hieracium (halcón) y (en parte) Potentilla (cinquefoil). Las especies de esos géneros son extremadamente difíciles de identificar (como se ve en el siguiente diagrama, tomado de Flora Gallica ), ya que las diferencias morfológicas son muy delgadas.
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