No se pueden cambiar las posiciones de protones y electrones en un átomo porque son partículas muy diferentes. No hay simetría entre electrones y protones.
Los protones están confinados al núcleo a pesar de su repulsión electrostática porque están sujetos a la fuerza fuerte. Los electrones no pueden ser confinados así porque no interactúan a través de la fuerza fuerte. Otra razón por la cual los electrones no pueden limitarse al núcleo es que son ligeros, 1000 veces más ligeros que los protones. Cuando intenta limitar una partícula mecánica cuántica a un volumen pequeño, la incertidumbre en el momento aumenta en consecuencia (principio de Heisenberg) y para las partículas de luz, la incertidumbre en la velocidad se aproxima a la velocidad de la luz. Además, los electrones están sujetos al principio de exclusión de Pauli (no puede haber dos electrones en el mismo estado cuántico). A menos que haya una fuerza fuerte y atractiva para contrarrestar estos efectos, es imposible confinar electrones en un volumen pequeño.
La otra razón es la inercia. Los electrones giran alrededor del núcleo por la misma razón por la cual la tierra gira alrededor del sol y no al revés: los objetos más masivos son más difíciles de mover.
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Un sistema enlazado similar a un átomo entre un electrón y un positrón (llamado positronio) es una historia diferente. Como tienen la misma masa y son iguales en todos los aspectos, excepto en la carga, se rodean entre sí en lugar de que los electrones rodeen el positrón.