La heterocigosidad agrega efectos de dominación y más variables, lo que complica el análisis. Las líneas heterocigotas tampoco son una verdadera reproducción, por lo que, dependiendo de cómo configure el experimento, también significa tratar con la heterogeneidad.
En el caso de los cultivos endogámicos, los endogámicos son el tema de interés. Entonces deberías estudiar los consanguíneos.
En el caso de los cultivos híbridos, se deben usar híbridos (al menos un cruce de prueba para los datos fenotípicos), a menos que el rasgo de interés tenga un alto correlario endogámico / híbrido (es decir, baja variación de dominancia). Este es uno de los problemas cuando un genetista diseña un experimento de fitomejoramiento.
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Puede realizar análisis genéticos, incluido el análisis QTL, utilizando todo tipo de poblaciones, es solo que debe tener el software adecuado. Los diferentes diseños de población tienen ventajas y desventajas.
