Si. Hay varios métodos que puede usar para hacer esto. Algunos le dicen qué regiones generales del genoma están metiladas en el tipo de célula de interés, pero si desea saber exactamente qué bases de ADN (“letras”) están metiladas, debe usar una técnica llamada secuenciación de bisulfito (llamada bisulfito en EE. UU. Inglés).
El primer paso es extraer el ADN del tipo de célula de interés y dividir la muestra en dos. Luego secuencia una porción “normalmente”, para determinar la secuencia de bases A, C, G y T.
Antes de secuenciar la otra porción, la trata con un químico llamado bisulfito de sodio. Este producto químico convierte cada base C no metilada en una base T. Sin embargo, las bases C metiladas están protegidas de esta conversión, por lo que permanecen como Cs. Luego secuencia el ADN y lo compara con la primera secuencia (no tratada con bisulfito) para ver qué Cs se convirtió en Ts.
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Como ejemplo, si tiene un fragmento de ADN con la secuencia AACGTmCGT y lo trata con bisulfito, la C normal se convertirá en una T, pero la C metilada (mC) no. Entonces, cuando compara la secuencia de 1) el ADN original no tratado y 2) el ADN tratado con bisulfito, verá esto:
- AACGTCGT
- AATGTCGT
Entonces, esta comparación muestra dónde debe haber estado el m (grupo metilo).
