El genotipado de SNP es la medición de variaciones genéticas de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) entre miembros de una especie. Es una forma de genotipado, que es la medición de la variación genética más general. Los SNP son uno de los tipos más comunes de variación genética. Un SNP es una mutación de un solo par de bases en un locus específico, que generalmente consta de dos alelos (donde la frecuencia rara de alelos es> 1%). Se ha descubierto que los SNP están involucrados en la etiología de muchas enfermedades humanas y están adquiriendo un interés particular en la farmacogenética. Debido a que los SNP se conservan durante la evolución, se han propuesto como marcadores para su uso en análisis de loci de rasgos cuantitativos (QTL) y en estudios de asociación en lugar de microsatélites. El uso de SNP se está extendiendo en el proyecto HapMap, que tiene como objetivo proporcionar el conjunto mínimo de SNP necesarios para genotipar el genoma humano. Los SNP también pueden proporcionar una huella genética para su uso en pruebas de identidad.
El aumento del interés en los SNP se ha reflejado en el desarrollo furioso de una amplia gama de métodos de genotipado de SNP.
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