Tanto el “hidrógeno atómico” como el “hidrógeno naciente” no son más que un solo átomo de hidrógeno aislado, aislado (aún sin formar un enlace). Más, término correcto, gaseoso, por lo que ambos tienen las mismas propiedades físicas y químicas.
Sin embargo, el hidrógeno naciente evoluciona de la reacción (como la reacción del metal alcalino con agua, ácido) que acaba de ocurrir hace un momento, por lo que ganaría algo de energía liberada (exotérmica) de la reacción y, por lo tanto, sería más reactivo.
En el caso de JUSTO hidrógeno atómico, simplemente existió, no evolucionó a partir de ninguna reacción química, de fisión nuclear o física: no tendría ninguna energía externa. Y, supongamos que debido a la influencia gravitacional externa, gana aceleración de acuerdo con el postulado de Maxwell eventualmente perdería toda su energía hasta que dejara de existir (¡pero llevaría muchísimo tiempo!).
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CONCLUSIÓN: el hidrógeno naciente es más reactivo