Los procesos epigenéticos representan otro mecanismo por el cual nuestra genética y el medio ambiente interactúan. Hay tres áreas principales de adaptación genética que pueden moldear el fenotipo con el tiempo (evolucionarlo).
El mecanismo más lento es la mutación por la cual una especie se adapta a un entorno alterando el ADN a través de la mutación. Este es un proceso aleatorio que solo puede lograrse de manera eficiente por organismos unicelulares que tienen una rápida rotación de generaciones y pueden compartir mutaciones beneficiosas entre sí (transferencia horizontal de genes). En humanos, este método lleva miles de años.
La reproducción sexual es muy eficiente para mantener las mutaciones en el genoma a baja frecuencia en una población. Cuando el entorno cambia, es probable que una de estas variaciones esté ‘preadaptada’, es decir, que ya sea adecuada para ese entorno. La frecuencia de esa variación aumenta en la población. Este proceso solo lleva cientos de años.
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La adaptación más rápida es a través de la epigenética, que puede producir adaptación en toda la vida y puede persistir durante algunas generaciones, incluso si no se produce más estimulación ambiental.
Entonces, en lugar de desafiar la epigenética de la teoría de la evolución, cumple un papel para el que anteriormente no había explicación. Esto ahora está incluido en la teoría de la evolución y juega un papel importante. (la regulación génica mediante, por ejemplo, la modificación de histonas, a veces se considera por separado de la epigenética y, por lo tanto, representaría la capacidad de adaptación más rápida).
En cuanto al creacionismo, podría haber un argumento de que algunas especies son simplemente variaciones de las creadas originalmente a través de cambios epigenéticos, pero eso no explicaría las muchas especies extintas que tienen una composición genética muy diferente y no solo una simple variación inducida epigenética.