¿Se puede marcar RNApol con un fluoróforo sin preocuparse por la interferencia en la transcripción?

Respuesta corta:

RNApol II puede marcarse con un fluoróforo, incluido GFP, y retener su actividad. Sugaya, Vigneron y Cook [1] marcaron una subunidad RNApol II con GFP y encontraron actividad transcripcional en células de mamíferos a pesar de la etiqueta voluminosa. Entonces, sí, se puede hacer.

Cosas a considerar para los experimentos:

Al incorporar la etiqueta, asegúrese de que la etiqueta y sus dominios no interfieran con los dominios RNApol II, especialmente los dominios involucrados en el ensamblaje de subunidades y la catálisis. Y si desea observación in vivo , le recomendaría un fluoróforo que tenga una longitud de onda de excitación más baja; no desea que la luz de longitud de onda corta pueda causar mutaciones.

¡Buena suerte!

Referencias

[1] Sugaya, K., Vigneron, M. y Cook, PR (2000). Líneas celulares de mamíferos que expresan ARN polimerasa II funcional marcadas con la proteína verde fluorescente. Journal of Cell Science, 2679-2683. Consultado el 17 de diciembre de 2016.