Como señala Israel Ramírez, los métodos tradicionales incluyen comparar las similitudes anatómicas (utilizando el conocimiento de otros organismos como contexto) o mirar el cariograma (es decir, la visualización de los cromosomas).
Quería agregar un breve ejemplo para ayudar a visualizar cómo la secuenciación moderna del genoma completo puede ayudarnos. (Por supuesto, también hay métodos mucho más involucrados).
Usando una de las dos especies como referencia, usamos un algoritmo que alinea piezas similares del otro genoma a su ubicación correspondiente. Luego graficamos la ubicación en un genoma versus la ubicación en el otro en un diagrama de dispersión. El resultado se verá así:
- ¿Por qué los mamíferos y los reptiles tienen un par de fosas nasales?
- ¿Cómo difieren la variación y la selección natural?
- ¿Cómo evolucionarán las tortugas marinas para adaptarse a las luces confusas (https://youtu.be/thDTzgJKJO4?t=57s)?
- ¿Por qué los animales tienen una cola en la parte trasera?
- ¿Por qué la evolución tarda tanto en cambiar una especie?
En el caso de la izquierda, los dos genomas están bastante bien alineados. Algunas partes del genoma de referencia no están presentes en el otro y viceversa, visibles como huecos en la dirección horizontal y vertical.
En el caso de la derecha, ha habido algunas mutaciones que han invertido partes del genoma (aunque la trama no nos dice en qué genoma se produjeron estas inversiones). Pero casi todo el genoma de referencia está presente, y una pequeña parte incluso está duplicada.
Estos tipos de parcelas nos muestran exhaustivamente las deleciones, duplicaciones e inversiones genómicas a gran escala que se han producido desde la separación evolutiva de las dos especies. Para las especies que están más separadas, la parcela se verá cada vez más desordenada y desordenada, y menos como una línea recta.
