Lo que importa no son los valores positivos o negativos de las funciones de onda, sino que es el cuadrado absoluto de la función de onda el que representa la densidad de probabilidad de encontrar la partícula en el punto donde se calcula el cuadrado absoluto de la función de onda.
Para valores positivos y negativos, podemos tomar el ejemplo más simple de una partícula en una caja rígida unidimensional. Si escribimos en este caso la ecuación de Schrodinger y la resolvemos y luego aplicamos las condiciones de contorno que la función de onda psi = o, en x = 0 yx = L, donde se ha tomado una caja de longitud L en el eje x, encontramos la función de onda psi = A sin (pi nx / L). Aquí, n = 1,2,3, … n = 1 da el estado fundamental, n = 2 da el primer estado excitado y así sucesivamente.
En este ejemplo simple, podemos ver que como la función sin tiene valores positivos y negativos, la función de onda también tiene valores positivos y negativos.
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Si la partícula es electrónica, entonces e | psi | ^ 2 da la densidad de carga de probabilidad de carga electrónica.