En una PCR, ¿cómo desarrolla una cadena de ADN la segunda cadena? ¿Es como el crecimiento de cristales?

Es parcialmente como el crecimiento de cristales. Se siembra la nueva cadena con una corta longitud de ADN llamada cebador, y es este cebador el que identifica el gen que desea copiar y se une a ese de manera única. Hiciste tu sopa con muchos nucleótidos separados (dATP, dGTP, dTTP y dCTP) y esos comienzan a unirse descuidada y aleatoriamente a sus bases complementarias en la primera cadena, una especie de cristalización.

Si no tuviera la enzima ADN polimerasa, obtendría una especie de doble hélice con muchas imperfecciones. Pero como preparó su sopa correctamente, la ADN polimerasa se adhiere a la doble cadena corta y se asegura de que cada nuevo nucleótido individual se coloque correctamente, luego se une covalentemente a la cadena del cebador. Este proceso de alargamiento continúa por el primer filamento para completar la doble hélice.

Entonces, esta enzima se acelera y controla un proceso más preciso de replicación del ADN. Como probablemente sepa, el siguiente paso en la PCR es calentar el ADN hasta que hierva esencialmente. Esto hace que las dos hebras se separen, lado solo están unidas por enlaces de hidrógeno, los mismos enlaces eléctricos débiles que mantienen juntas dos moléculas de agua y evitan que floten en el aire.

Hervir la sopa, por supuesto, también desnaturalizará la mayoría de las enzimas, incluida la ADN polimerasa, al igual que hervir un huevo desnaturaliza las proteínas de la clara de huevo. Pero fuiste muy inteligente acerca de dónde obtuviste tu ADN polimerasa.

Básicamente, lo que sucede es que tenemos una mezcla de cebadores, nucleótidos de ADN libres, ADN polimerasa (no polimerasa humana, una especie de polimerasa bacteriana que no se desnaturaliza a las altas temperaturas de la PCR) y, por supuesto, nuestra cadena de ADN que queremos copiar o amplificar.

Luego calentamos la mezcla para que los enlaces de hidrógeno se rompan entre las cadenas de ADN (a alrededor de 95 * C).

Luego lo enfriamos para permitir que los cebadores se unan a las hebras ahora individuales.

Cuando se calienta la mezcla de nuevo a la temperatura en la que funciona la polimerasa. Luego utiliza los nucleótidos de ADN libres para hacer dos cadenas nuevas idénticas a la original.

El proceso se realiza nuevamente, con el calentamiento, el enfriamiento y luego el calentamiento nuevamente para hacer dos hebras nuevas por cada hebra que creamos.

Podemos hacer esto tantas veces como queramos siempre que tengamos suficientes nucleótidos de ADN libres.

No. El ADN se desnaturaliza a una cierta temperatura y la enzima polimerasa replica cada cadena utilizando nucleótidos y cebadores.

Cebadores, cadenas oligoméricas, se unen al ADN desnaturalizado. Luego, la enzima polimerasa se adhiere al ADN y comienza a hacer un ADN bicatenario a partir de una pieza monocatenaria. Una sola cadena puede complementarse porque cada nucleótido tiene una pareja específica en la otra cadena. A para T, G para C, viceversa. La polimerasa une estos nucleótidos de la solución y se forman ADN de doble cadena. Este es un ciclo único de PCR. El ciclo comienza nuevamente desde el punto de desnaturalización y duplica el ADN nuevamente. Enjuague y repita hasta que obtenga el número deseado de ADN bicatenario o los nucleótidos se agoten. Aunque se recomienda detener la PCR antes del agotamiento, ya que podría provocar errores.

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PCR es un acrónimo de reacción en cadena de la polimerasa. Está impulsada por una enzima, la polimerasa, y se dice que la enzima es responsable de producir la nueva cadena a partir de la plantilla de ADN inicial (que es una molécula de ADN de cadena antiparalela original 2)